虽仅有一章的短信，因内容的重要与宝贵，也须要详细分析查考，作学习道理的帮助。

一、开端的问候（1－3）：和别书信的方式一样，在此是问腓利门及其家族，并在他家里的教会的安（他家里的教会，也许即歌罗西教会）。

二、感谢与祈祷（4－7）

　1.为腓利门的信心和爱心感谢神（4－5）。

　2.愿他与人同有的信心显出功效（6）。

　3.因他的爱心得了快乐和安慰（7）。

三、替阿尼西母向腓利门恳求（8－21）

　1.保罗陈述自己的地位（8－9）：年老的被囚者为爱心而求的。

　2.介绍阿尼西母信主后，完全的改变（10－16）。

　3.恳请腓利门收纳阿尼西母（17－19）：留意18－19节保罗的爱心，愿为阿尼西母的亏欠作保。

　4.表白对腓利门的信任（20－21）：由这两节看出保罗所言何其巧妙，使腓利门不得不乐意顺服而行了。

四、结束的问安与祝福（22－25）

　1.为自己的恳请（22）：保罗虽在监里，乃盼望不久能得释放，可以到歌罗西腓利门的家里去，就特意恳请为他预备住处，可知保罗打发阿尼西母去的时候，他的心也一同到腓利门的家里了，这是何等亲热的表示！

　2.同工者的问安（23－24）：在此所列举的问安者，除「称犹士都的耶数」之外，都与「西四10－14」所记的相同（不加入犹士都或因腓利门不认识他吧）。

　　·「同坐监的以巴弗」和「西四10」的亚里达古一样，因为爱，要在监里服事保罗，自愿和保罗同坐监的。

　3.「愿主耶稣基督的恩，常在你的心里」（25）：这一句可按原文翻译为「愿主耶稣基督的恩常与你们的灵同在」（参考提后四22），表示保罗重视人的灵，与需要基督的恩，他的书信最后都以此祝福之言为结束。