虽把本书的内容，一一分析清楚了，下面再把其中特别重要之道理，举出来加以说明。

一、愿与人同有的信心显出功效来（6）：

　　这一句是在第4节所祷告的主题。「所同有的」可译为「团契」，即信主的同灵，都要在同一信仰的团契里，彼此相交、相爱相助（林前十二26；弗四16）。信徒在团契里有照样显出信心的功效，而为基督作各样的善事，才是极大的快乐。腓利门是极有爱心的，所以保罗才为他如此祈愿，又相信必有效果的（7）。

二、信徒的「从前」与「如今」的差别（11）：

　　每个信徒入信，都应该有像阿尼西母的改变，前后判若两人；即从前是罪的奴仆，放纵各样的私欲，在黑暗中生活，是死人，对自己和别人都没有益处的；如今蒙恩，悔改归主以后，必脱离各样的私欲和罪恶，重生为义人在光明中生活，表现出新人的形像来，无论对任何人都成为有益处的（参考弗二3－7；罗六17－18；弗四21－24；五7－9）。撒该乃显出此实例的一人（路十九8）。

三、保罗的大爱（18、13－14）：

在保罗各书信里，到处表现了他极大的爱心，使人受感动！例如：「我甘心乐意，为你们的灵魂费财费力」（林后十二15），「如同母亲乳养自己的孩子」，「连自己的性命也愿意给你们」（帖前二7－8）……等。而对阿尼西母的爱，是要担负了人类对神所亏欠的罪债一样的爱，真是本书内宝贵的道理。保罗在监里受苦，得了重生的阿尼西母为「心上的人」，虽然想把他留下来服事自己，但他不这样作。宁愿自己忍受困苦，而将心上人差回腓利门那里去帮助他（12－14）保罗的爱何其伟大呀！

四、赎罪的真理

人类须要赎罪之恩，不是借着神学理论，乃是在事实上，由实际的行为表现出来的。在腓利门书内，保罗为所爱的门徒阿尼西母，担代他对腓利门所欠的债，我们可以看明主耶稣为衪所爱的世人，牺牲自己，赎出人类对神所犯的罪债的真理。因保罗对阿尼西母所行的，和主耶稣为世人所行的，是出乎同一的精神，同样的原理。现在我们得主赎罪之恩，在灵意上，每个人都是耶稣基督的阿尼西母。

五、解放奴隶的福音

　　有人称腓利门书为解放奴隶的福音书。据说美国伟大的总统：林肯解放了当时美洲五百多万的黑人奴隶，是读了本书受感动而实行的。

　　·在本书内保罗并没有记载要叫人解放奴隶，阿尼西母是腓利门的奴仆，逃走之后，保罗引导他作了信徒，还是叫他回去服事原来的主人，又叫腓利门再收纳他（15、17）。但要留意16节说的：「不再是奴仆，是高过奴仆，是亲爱的兄弟」一言就够了。在主内的信徒家里，若有奴仆，主人能照保罗所教训，看奴仆为亲爱的兄弟，不用威吓或加以压迫、虐待，只以慈爱对待他，合乎「不分犹太人、希利尼人；自主的、为奴的……在基督里都成为一了」（加三28）。在神家里的人若都实行这宝贵的真理，那么，当奴仆的，就自然而然被解放了。